Γεννήθηκε στην Κωνσταντινούπολη το 1771. Ο πατέρας της ήταν ο Σταυριανός Πινότσης και η μητέρα της η Σκευω Κοκκίνη. Η ίδια γεννήθηκε στις φυλακές λόγο της συμμετοχής του πατέρα της στα Ορλωφικά.
Μετά το θάνατο του πατέρα της μετακομίζει πρώτα στην Ύδρα και μετά στις Σπέτσες μαζί με τη μητέρα της η οποία ξαναπαντρεύτηκε.
Η ίδια η Μπουμπουλίνα έκανε δυο γάμους με ναυτικούς που πέθαναν και κληρονόμησε την περιουσία τους. Αυτή την περιουσία τη διέθεσε για την επανάσταση του 1821.
Το 1816 η περιουσία της απειλήθηκε καθώς οι Οθωμανοί ήθελαν να δεσμεύσουν τα πλοία που ανήκαν στο δεύτερο της σύζηγο επειδή όπως ισχυρίστηκαν αυτά τα πλοία πήραν μέρος σε Ρωσοτουρκικούς πολέμους κατά των Τούρκων.
Η ίδια βρίσκει τον Ρώσο πρέσβη στην Κωνσταντινούπολη ο οποίος τη συμβουλεύει να πάει με τα πλοία της στην Κριμαία μέχρι να ηρεμήσει η κατάσταση με τους Τούρκους.
Στην Κωνσταντινούπολη συναντάει και τη μητέρα του Σουλτάνου η οποία τη συμπαθεί και πείθει τον γιο της να βγάλει φιρμάνι ότι δε θα κινδυνεύει ούτε η Μπουμπουλίνα ούτε τα πλοία της από τους Τούρκους.
Για τρεις μήνες πάει στην Κριμαία και κατόπιν επιστρέφει στην Ελλάδα.
Η Μπουμπουλίνα ήταν ενεργό μέλος της φιλικής εταιρείας οπότε ήξερε όλες τις εξελίξεις από πρώτο χέρι. Ήταν στο στόχαστρο των Τούρκων και είχε μετατρέψει το σπίτι της σε μπαρουταποθήκη καθώς είχε ξεκινήσει την προετοιμασία για την επανάσταση. Επίσης, είχε ιδρύσει τον δικό της επανδρωμένο στόλο με παλικάρια από τις Σπέτσες τους οποίους πλήρωνε η ίδια.
Σε μάχη για το Άργος έχασε το γιό της και παρόλα αυτά είχε τη δύναμη να πανηγυρίσει που το Άργος παρέμεινε ελεύθερο. Είχε επίσης καθοριστικό ρόλο στις μάχες για το Ναύπλιο και την Τρίπολη και το 1922 της δόθηκε για αντάλλαγμα κλήρος από το κράτος ως ένδειξη αναγνώρισης του έργου της κατά τη διάρκεια της επανάστασης.
Στη συνέχεια η ίδια μετακόμισε στην περιοχή. Τα επόμενα χρόνια του εμφυλίου που ακολούθησαν ήταν δύσκολα. Η Μπουμπουλίνα αντέδρασε στη φυλάκιση του Κολοκοτρώνη και η κυβέρνηση τη συνέλαβε καθώς τη θεώρησε επικίνδυνη. Έτσι χάνει τον κλήρο που της είχε δώσει το κράτος και εξορίζετε στις Σπέτσες.
Καθώς ετοίμαζε ναυτική εκστρατεία κατά του Ιμπραήμ που ήρθε από την Αίγυπτο για να βοηθήσει τους Τούρκους, μαθαίνει ότι ο γιος της είχε κλέψει μια κοπέλα με σκοπό να την παντρευτεί και η οικογένεια της αντιδρούσε ως προς αυτό.
Η Μπουμπουλίνα πήγε για να υποστηρίξει το παιδί της και σε μια συμπλοκή ένας από τους συγγενής της κοπέλας την πυροβολεί και τη σκοτώνει. Οι άνθρωποι στην Ελλάδα ταράζονται από αυτό το γεγονός όχι όμως και οι άρχοντες του τόπου. Ως φόρο τιμής η Ρωσία της δίνει τον βαθμό του ναύαρχου κάτι που ήταν μεγάλη τιμή για μια γυναίκα τα χρόνια εκείνα.
Η Ελλάδα πολλά χρόνια αργότερα και συγκεκριμένα τον Απρίλιο του 2018 με εγκύκλιο που εκδόθηκε από το υπουργείο Εθνικής Άμυνας με υπογραφή του Αντιπλοίαρχου Ιωάννη Καλογερόπουλο της έδωσε τον βαθμό του υποναυάρχου.
